Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPHP41219 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPHP41219 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPHP41219 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPHP41219 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPHP41219 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPHP41219 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPHP41219 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPHP41219 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPHP41219 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPHP41219 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPHP41219 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPHP41219 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPHP41219 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPHP41219 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPHP41219 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPHP41219 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPHP41219 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPHP41219 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPHP41219 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPHP41219 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPHP41219 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPHP41219 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPHP41219 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPHP41219 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPHP41219 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms