Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL4AP40617 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL4AP40617 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms