Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FDFT1P37268 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FDFT1P37268 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms