Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM23P36406 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM23P36406 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms