Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYKP34925 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RYKP34925 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RYKP34925 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RYKP34925 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RYKP34925 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYKP34925 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RYKP34925 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RYKP34925 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYKP34925 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms