Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSP1P33241 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSP1P33241 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSP1P33241 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSP1P33241 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSP1P33241 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LSP1P33241 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSP1P33241 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSP1P33241 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSP1P33241 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSP1P33241 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSP1P33241 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSP1P33241 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSP1P33241 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSP1P33241 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSP1P33241 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSP1P33241 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms