Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBP1P32455 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP1P32455 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP1P32455 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP1P32455 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP1P32455 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP1P32455 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP1P32455 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP1P32455 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP1P32455 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP1P32455 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP1P32455 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP1P32455 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP1P32455 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP1P32455 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP1P32455 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP1P32455 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP1P32455 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP1P32455 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP1P32455 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP1P32455 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP1P32455 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP1P32455 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP1P32455 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP1P32455 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP1P32455 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP1P32455 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP1P32455 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP1P32455 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms