Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4AP27815 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4AP27815 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDE4AP27815 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE4AP27815 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4AP27815 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms