Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPREP23469 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPREP23469 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPREP23469 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPREP23469 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPREP23469 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPREP23469 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPREP23469 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPREP23469 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPREP23469 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPREP23469 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPREP23469 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPREP23469 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPREP23469 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPREP23469 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPREP23469 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPREP23469 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPREP23469 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPREP23469 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPREP23469 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPREP23469 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPREP23469 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPREP23469 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPREP23469 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPREP23469 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPREP23469 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPREP23469 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPREP23469 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms