Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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