Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BGNP21810 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BGNP21810 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BGNP21810 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BGNP21810 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BGNP21810 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BGNP21810 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BGNP21810 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BGNP21810 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BGNP21810 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BGNP21810 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BGNP21810 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BGNP21810 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BGNP21810 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BGNP21810 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BGNP21810 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BGNP21810 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BGNP21810 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BGNP21810 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BGNP21810 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BGNP21810 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BGNP21810 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BGNP21810 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BGNP21810 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BGNP21810 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BGNP21810 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms