Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms