Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D1P20393 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms