Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
AMY2BP19961 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms