Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TNNI3P19429 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNNI3P19429 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNNI3P19429 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms