Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFKLP17858 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKLP17858 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKLP17858 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKLP17858 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKLP17858 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKLP17858 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKLP17858 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKLP17858 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKLP17858 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKLP17858 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFKLP17858 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKLP17858 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKLP17858 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKLP17858 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKLP17858 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKLP17858 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKLP17858 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFKLP17858 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFKLP17858 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFKLP17858 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFKLP17858 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFKLP17858 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFKLP17858 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms