Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMD1P17707 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMD1P17707 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMD1P17707 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMD1P17707 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMD1P17707 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMD1P17707 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMD1P17707 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMD1P17707 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMD1P17707 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMD1P17707 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMD1P17707 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMD1P17707 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AMD1P17707 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMD1P17707 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms