Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHN1P15882 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHN1P15882 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHN1P15882 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHN1P15882 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHN1P15882 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHN1P15882 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHN1P15882 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHN1P15882 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHN1P15882 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHN1P15882 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHN1P15882 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHN1P15882 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHN1P15882 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHN1P15882 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHN1P15882 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHN1P15882 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHN1P15882 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHN1P15882 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHN1P15882 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms