Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB2P14652 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms