Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARGP13631 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARGP13631 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARGP13631 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARGP13631 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARGP13631 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARGP13631 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARGP13631 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARGP13631 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARGP13631 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARGP13631 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARGP13631 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARGP13631 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARGP13631 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms