Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFHP12036 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFHP12036 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFHP12036 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFHP12036 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEFHP12036 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEFHP12036 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFHP12036 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFHP12036 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms