Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2AP0DMW4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2AP0DMW4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2AP0DMW4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM10L2AP0DMW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM10L2AP0DMW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM10L2AP0DMW4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms