Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GIMD1P0DJR0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIMD1P0DJR0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms