Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGPD1P0DJD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms