Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms