Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF853P0CG23 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF853P0CG23 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF853P0CG23 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms