Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC175P0C221 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC175P0C221 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms