Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP1P09874 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP1P09874 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP1P09874 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP1P09874 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP1P09874 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP1P09874 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP1P09874 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP1P09874 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP1P09874 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PARP1P09874 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP1P09874 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP1P09874 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP1P09874 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP1P09874 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP1P09874 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP1P09874 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP1P09874 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP1P09874 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP1P09874 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP1P09874 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP1P09874 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP1P09874 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms