Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NGFRP08138 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NGFRP08138 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NGFRP08138 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms