Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms