Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBB4AP04350 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4AP04350 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4AP04350 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms