Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DRAP01903 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DRAP01903 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms