Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA21P01568 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms