Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCAP01258 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCAP01258 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCAP01258 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCAP01258 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCAP01258 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCAP01258 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCAP01258 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCAP01258 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCAP01258 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCAP01258 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCAP01258 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCAP01258 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCAP01258 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCAP01258 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCAP01258 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCAP01258 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCAP01258 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCAP01258 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCAP01258 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCAP01258 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCAP01258 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCAP01258 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCAP01258 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCAP01258 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCAP01258 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCAP01258 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCAP01258 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCAP01258 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCAP01258 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCAP01258 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCAP01258 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCAP01258 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCAP01258 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCAP01258 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms