Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX7O95931 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX7O95931 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX7O95931 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX7O95931 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX7O95931 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX7O95931 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX7O95931 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX7O95931 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX7O95931 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX7O95931 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX7O95931 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX7O95931 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX7O95931 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX7O95931 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms