Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
POLR1AO95602 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR1AO95602 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms