Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGDSO95455 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGDSO95455 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGDSO95455 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGDSO95455 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGDSO95455 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TGDSO95455 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGDSO95455 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGDSO95455 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGDSO95455 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGDSO95455 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGDSO95455 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGDSO95455 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGDSO95455 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGDSO95455 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGDSO95455 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGDSO95455 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGDSO95455 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGDSO95455 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGDSO95455 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGDSO95455 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGDSO95455 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGDSO95455 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGDSO95455 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms