Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF6BO95407 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFRSF6BO95407 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms