Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB11O95342 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB11O95342 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms