Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms