Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP2O75323 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP2O75323 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms