Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSCO60682 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSCO60682 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSCO60682 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MSCO60682 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSCO60682 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSCO60682 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSCO60682 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSCO60682 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSCO60682 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSCO60682 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSCO60682 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSCO60682 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSCO60682 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSCO60682 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSCO60682 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSCO60682 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSCO60682 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSCO60682 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MSCO60682 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSCO60682 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSCO60682 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSCO60682 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSCO60682 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSCO60682 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MSCO60682 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSCO60682 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms