Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOBOXO60393 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms