Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH6O60337 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms