Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BP5O60239 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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SH3BP5O60239 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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SH3BP5O60239 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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SH3BP5O60239 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP5O60239 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP5O60239 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5O60239 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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SH3BP5O60239 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5O60239 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5O60239 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5O60239 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5O60239 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5O60239 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5O60239 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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