Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3LO60238 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3LO60238 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms