Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR1O43759 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms