Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms