Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD51CO43502 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms