Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K13O43283 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms